Glossary entry (derived from question below)
English term or phrase:
warping/shifting vessel
Portuguese translation:
embarcação sendo alado pelas espias ou em deslocamento
English term
Portugal
Accurate, experienced and reliable
Native in: Portuguese (Variants: Brazilian, European/Portugal) 
Works in: English to Portuguese, German to Portuguese, Spanish to Portuguese, and 2 more.
warping/shifting vessel
An example of a similar direct loading facility (sans mooring buoys) is shown in Figure below.
It is noted that the proposed minimum CAPEX configuration has drawbacks with respect to operational efficiency, safety (requires warping/shifting vessel), and maintainability.
obrigada desde já pela ajuda
Proposed translations
Brazil
Brazilian lawyer - 40+ years in Brazil
Native in: English (Variants: US, Australian, Canadian, New Zealand, Scottish, British, UK, Irish) , Portuguese (Variants: Angolan, European/Portugal, Brazilian, Mozambican) 
Works in: Portuguese to English, English to Portuguese, English, and 1 more.
navio/embarcação sendo alado pelas espias ou em deslocamento
4. Nautical To move (a vessel) by hauling on a line that is fastened to or around a piling, anchor, or pier.
Alar uma espia - Puxar pela espia à mão.
http://www.thefreedictionary.com/warp
https://www.facebook.com/aprendizagemconhecimentomaritimo2015/posts/839754792714115
Israel
TNG Translation and Language Solutions
Native in: Portuguese
Works in: Portuguese to English, English to Portuguese, Spanish to Portuguese, and 3 more.
empenamento / deslocamento de navio
Portugal
Native in: Portuguese (Variant: European/Portugal)
Works in: English to Portuguese, Portuguese to English, French to Portuguese, and 1 more.
(exige) a movimentação/deslocamento/alagem do navio ao longo do cais
O que o texto refere é que a configuração proposta tem inconvenientes/ desvantagens relativamente à segurança porque exige/requer a movimentação/ deslocamento do navio ao longo do cais, apenas trabalhando/manobrando as amarras (alagem) (o que constitui uma operação algo perigosa).
vd links:
1. ("warp" »» 4. Nautical "To move (a vessel) by hauling on a line that is fastened to or around a piling, anchor, or pier."): http://www.thefreedictionary.com/warping
2. ("alagem" »» "NÁUTICA rebocar (uma embarcação)"): http://www.infopedia.pt/dicionarios/lingua-portuguesa/alar
Discussion
Concordo que "embarcação" é um termo mais genérico, que abrange todo tipo de barco, e seria mais apropriado para traduzir "vessel".
2) Vessel não deve ser traduzido como "navio" e sim como "embarcação", pois pode ser um rebocador, uma lancha ou até um submarino. No próprio texto deve haver o termo "ship", este sim referindo-se a navios.